| El convento existió antes que la iglesia, a la que más adelante quedaría adosado. Fue fundado por Fray Toribio Benavente Motilinía en 1529, para luego ser abandonado. En su primera construcción se utilizaron paredes de caña y techo de paja. En 1550 fue restaurado con los mismos materiales. En 1585, se crearon los cimientos del templo, pero no fue sino hasta la tercera o cuarta década del siglo XVII que se concluyó.
El convento y el templo de San Francisco fueron saqueados un 8 de diciembre de 1685 por las huestes al mando del pirata francés William Dampier, que invadió Granada desde la costa del pacífico. Producto de este saqueo el templo fue destruido casi en su totalidad, sobreviviendo únicamente su torre lateral (con tres espadañas), aunque esta afirmación todavía es un tema en debate. Se cree que el templo fue restaurado a finales del mismo siglo.
El obispo Fray Agustín Morel de Santa Cruz, quien recorriese Nicaragua en los años 1751/52, en su paso por Granada en 1751 describe el templo como una iglesia de una sóla nave rodeada de seis capillas. La iglesia fue dañada durante el incendio de Granada en 1856, para ser restaurada posteriormente con la fachada que actualmente ostenta. Por otro lado, el convento fue reformado en 1836 para servir de centro universitario y en 1874 fue nuevamente reformado para convertirse en sede del Colegio de Granada (luego Instituto Nacional de Oriente). Otras reformas ocurrieron en 1885, 1939 y 1950. La última restauración data el año 2000 y aun no se concluye.
Los patios del convento San Francisco, convertidos hoy en hermosos jardines, tuvieron diferentes utilidades en otras épocas. Se afirma que sirvieron como huertos combinados con zonas de servicio y acceso de carretas. Por otro lado, según exploraciones arqueológicas realizadas en los mismos, se ha encontrado cerámica precolombina (1200 a 1500 de nuestra era), así como restos humanos, producto de las ocupaciones militares de que fuera objeto durante la guerra civil de 1854, la Guerra Nacional (1855/56), así como los acontecimientos bélicos de 1910 y 1912. |
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